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Bioinformaticien.ne – Surveillance génomique du SARS-CoV2 H/F


Titre du poste: Bioinformaticien.ne – Surveillance génomique du SARS-CoV2 H/F

Compagnie: Institut Pasteur

Description de poste: Vous souhaitez intégrer un Institut de recherche d’Excellence guidé par la curiosité, L’Institut Pasteur, Institut de recherche Interdisciplinaire et Internationale contribue depuis 127 ans à l’histoire de la science, de la médecine et de la santé publique avec une immense renommée. Fidèle à l’esprit humaniste de son fondateur, l’Institut Pasteur défend le caractère avant-gardiste nécessaire à la conduite de recherches biomédicales de pointe. Dans le cadre de son activité de de surveillance génomique du virus SARS-CoV2, le Hub de Bioinformatique et Biostatistique de l’Institut Pasteur recrute deux bioinformaticien·ne·s. Ces deux personnes seront en lien direct avec le CNR des virus respiratoires. IIs. elles réaliseront pour ce dernier les tâches suivantes : * Exécution des workflows d’analyse des séquençages de virus SARS-CoV2 * Vérification des résultats de séquençage * Amélioration/maintenance des pipelines d’analyse * Dépôt des données dans des bases de données publiques * Production de rapports hebdomadaires à partir des données de séquençage publiques * Recherche de nouvelles mutations et identification de nouveaux variants Bac +5 informatique/bioinformatique. * Maitrise des outils d’analyse de génomique * Maitrise des outils et méthodes classiques d’analyse de données NGS (contrôle de qualité, assemblage, mapping, quantification, recherche de ) * Maitrise des outils de visualisation de données génomiques * Bonne connaissance de Python, Bash, R * Connaissance des notions fondamentales de statistiques (Analyse descriptive uni- et multivariée, tests d’hypothèse, modèles linéaires). * Connaissance de Nextflow serait un plus * Connaissance du développement d’application Shiny serait un plus * Mettre en place des workflows d’analyse au niveau national en lien avec les Ingénieur·e·s de l’IFB La personne devra savoir travailler en équipe et être force de proposition. Elle devra avoir des qualités de méthode et de rigueur, être autonome et avoir un bon relationnel. Le Hub et l’Institut Pasteur s’engagent à promouvoir la parité, les candidatures féminines sont encouragées.

Salaire prévu:

Lieu: Paris

Date de l’emploi: Sat, 26 Jun 2021 07:55:08 GMT

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